داستان از جایی شروع شد که پوکمون یه پسربچه رو کنار رودخونه پیدا کرد؛ تصمیم گرفت اون رو به جنگل بیاره و مثل بچه‌ی خودش بزرگ کنه. حالا ده سال گذشته؛ پسربچه بزرگ شده و اسمش کوکوئه. کوکو بعد از سال‌ها اتفاقی با انسان‌ها روبه‌رو می‌شه و می‌فهمه بیرون جنگل یه دنیای دیگه هم هست. کوکو کم‌کم از انسان‌ها خوشش میاد، ولی وقتی می‌فهمه اونا قراره به جنگل حمله کنن و همه‌چی رو از بین ببرن، تصمیم می‌گیره از خونه و دوست‌هاش حمایت کنه. از درسا تکون نخورین تا ببینیم کوکو و دوست‌هاش چطور جنگل رو نجات می‌دن!